Par sa famille maternelle, Jean-Claude Meyer est lié (son arrière grand-oncle Théophile Bader) à la famille fondatrice des Galeries Lafayette, dont son grand-père, Gaston Lehmann, fut administrateur.

Par sa famille paternelle, il est lié à une ancienne banque de gestion de fortunes, Wellhoff et Cie ; la famille Wellhoff s’étant par ailleurs illustrée par Michel Bréal (1832-1915), professeur au Collège de France, membre de l’Institut, linguiste, beau-père de Romain Rolland, Prix Nobel.